中教数据库 > 东北林业大学学报 > 文章详情

偏肿革裥菌细胞色素P450基因在刚果红脱色条件下的差异表达

更新时间:2019-09-30

【摘要】摘要:为了明确白腐真菌偏肿革裥菌(Lenzites gibbosa)降解双偶氮染料刚果红过程中细胞色素P450基因的功能,采用高通量测序技术对刚果红染料处理0、3、7、10 h下的菌丝样本进行转录组测序,以比对到参考基因组上的每个基因的reads数即Count值作为表达量值,根据基因在对照组(0 h)和染料处理组(3、7、10 h)中表达量的变化,用DESeqEBSeq软件进行样品组间的差异基因表达分析和差异基因筛选,对差异表达基因(DGEs)在eggNOG、GO和KEGG等数据库中进行功能注释与通路富集分析,对筛选出的相关差异基因在NCBI上进行DNA序列比对,并与相关参考文献进行比较分析。结果表明:在转录组所有的DGEs中,搜索出11个可能影响L. gibbosa降解刚果红过程的细胞色素P450基因,其中在CK vs GGH1(0 vs 3 h)中未筛选出细胞色素P450差异基因,在CK vs GGH2(0 vs 7 h)中筛选出3个差异基因,在CK vs GGH3(0 vs 10 h)中筛选出8个差异基因,表明在L. gibbosa对刚果红染料脱色降解过程中细胞色素P450基因逐步参与了降解脱色过程。在10 h时,被注释到木质素降解关键通路ko 01220(芳香族化合物降解)中的gene25488表现出差异表达。从11个细胞色素P450基因的差异表达中可以探究并揭示出一些潜在的生物学规律,最终结果表明L. gibbosa的细胞色素P450基因与双偶氮类染料刚果红的降解脱色有一定的关系。

【关键词】 偏肿革裥菌 染料降解 基因差异表达 细胞色素P450

29 免费 知网

发表评论

登录后发表评论 (已发布 0条)

点亮你的头像 秀出你的观点

0/500
以上留言仅代表用户个人观点,不代表中教立场
相关文献

薇甘菊颈盲蝽细胞色素P450 PmCYP4 基因克隆及表达分析 更新时间:2019-07-19

【摘要】【目的】薇甘菊颈盲蜷是人侵植物薇甘菊的天敌昆虫。CYP4家族基因在专食性昆虫与宿主植物的相互作用中发挥 着极其重要的作用,探明其在不同部位的表达情况,可为薇甘菊生物控制提供科学依据。【方法】采用RA...

《华东昆虫学报》 | 2019年1期 | 季梅

0 0 -- 免费 收藏

海洋放线菌细胞色素P450 基因的克隆和分析 更新时间:2018-02-27

【摘要】 本文研究克隆海洋放线菌Salinispora arenicola 细胞色素P450 基因,以期为后续研究奠定基础。根据已发表的细胞色素P450 基因设计两对特异性引物,采用PCR 方...

《现代食品》 | 2017年24期 | 马艳玲

0 83 -- 免费 收藏

B16细胞黑色素合成关键基因表达的影响 更新时间:2020-02-20

【摘要】溶质转运蛋白家族相关基因在黑色素合成过程中发挥着重要作用。为了进一步证明新发现的SLC6A9和 SLC38A4两个候选基因在黑色素合成/沉积过程中的作用,以小鼠黑色素瘤B16细胞作为受试细胞,通过si...

《乐山师范学院学报》 | 2019年12期 | 王钢

0 0 -- 免费 收藏

细胞色素P450基因多态性与药物性肝损伤的关系 更新时间:2020-06-12

【摘要】随着药物性肝损伤患病率的逐年上升,药物性肝损伤发病机制成为了关注的焦点。CYP450酶作为一个庞大的家族,参 与了药物在人体肝脏内的几乎所有氧化代谢反应。近年来发现CYP450酶的基因多态性导致了药效...

《临床肝胆病杂志》 | 2020年5期 | 王巧玲

0 0 -- 免费 收藏

辐射影响细胞色素P450的研究进展 更新时间:2019-06-06

【摘要】随着科学的进步,核能和核技术已经广泛应用于医疗、能源、军事、食品加工等国防和国民生活的方方面 面。可能受到福射损伤的人群主要有接受放疗的癌症患者、从事与放射相关的工作人员和生活在高原、地区的人们 ...

《药学研究》 | 2019年5期 | 辛元尧

0 0 -- 免费 收藏

推荐期刊

Copyright © 2013-2016 ZJHJ Corporation,All Rights Reserved

京ICP备15058941号-1

京公网安备 11011102000866号