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小黑杨应答叶枯病胁迫基因差异表达

更新时间:2019-09-30

【摘要】摘要:为揭示小黑杨(Populus simonii×P. nigra)在叶枯病病原菌(Alternaria alternata)胁迫下基因差异表达情况,以叶枯病病原菌接种叶片处理组,以无菌PDA培养基处理为对照组,用Illumina Hi Seq测序平台对来自小黑杨叶片的RNA进行测序。结果表明:共得到551个差异表达基因,对差异表达基因进行功能注释并整理分类,获得112个编码酶类的基因,116个编码蛋白的基因。通过与GO数据库比对,其中38个差异表达基因属于生物过程,有333个差异表达基因属于分子功能,有11个差异表达基因属于细胞组分。通过与KEGG数据库进行比对,获得14条代谢通路。与TFDB数据库比对,发现27个转录因子,属于14个转录因子家族。

【关键词】 转录组 叶枯病 小黑杨 差异表达基因 高通量测序

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